Działalność mieszana to wykonywanie działalności gospodarczej zarówno uprawniającej, i również nieuprawniającej do odliczenia VAT. Bazuje ona na tym, że wszelki zakup należy zaklasyfikować do odpowiedniego modelu działalności, tzn. odrębnie do działalności opodatkowanej i osobno do zwolnionej z VAT. W przypadku jeżeli nie jest możliwe wyodrębnienie całości lub elementów kwot, podatnik ma możliwość zmniejszyć sumę podatku należnego o taką część podatku naliczonego, którą można proporcjonalnie przypisać czynnościom, przez które posiada prawo do obniżenia sumy podatku należnego. Proporcję odpisania VAT wyznacza się jako udział rocznego obrotu poprzez czynności, w związku z którymi przysługuje prawo do obniżenia sumy podatku należnego, w całkowitym obrocie pozyskanym z tytułu obu rodzajów wykonywanejdziałalności. Wskaźnik proporcji odliczenia VAT w wyznaczonym roku podatkowym oblicza się w procentach w stosunku rocznym. Do odliczania sumy VAT naliczonego przyjmuje się współczynnik proporcji wyznaczony na poziomie szacunkowym, według szacunkowego poziomu sprzedaży opodatkowanej i zwolnionej. Wartość tego współczynnika wymaga jednak zezwolenia naczelnika urzędu skarbowego w formie protokołu.